Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERCC6Q03468 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERCC6Q03468 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms