Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREMQ03060 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREMQ03060 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CREMQ03060 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms