Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 PDLIM5-208ENST00000504489 538 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CLEC5A-207ENST00000551012 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 VTA1-201ENST00000367621 1284 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MFSD8-243ENST00000641695 1455 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SLC14A1-203ENST00000415427 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms