Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZBED6P86452 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms