Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms