Protein–RNA interactions for Protein: P78527

PRKDC, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKDCP78527 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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