Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HBBP68871 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HBBP68871 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms