Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UFM1P61960 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms