Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms