Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDL3P58872 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHBDL3P58872 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms