Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT8P50990 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCT8P50990 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms