Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTPAP49638 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms