Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPD2P43304 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms