Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MDH1P40925 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MDH1P40925 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MDH1P40925 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MDH1P40925 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MDH1P40925 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MDH1P40925 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MDH1P40925 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
MDH1P40925 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms