Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5C1P36542 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms