Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXC13P31276 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms