Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA7P31268 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms