Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO2P25791 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO2P25791 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LMO2P25791 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms