Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD247P20963 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD247P20963 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms