Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LIG1P18858 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LIG1P18858 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LIG1P18858 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LIG1P18858 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LIG1P18858 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms