Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC092139.3-201ENST00000624764 968 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ETNK2-201ENST00000367197 843 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 BX322234.2-202ENST00000435612 479 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LINC01504-203ENST00000451596 671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 BX322234.2-201ENST00000457833 654 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC114781.2-201ENST00000515670 394 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CR589904.1-203ENST00000636515 318 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 BLNK-202ENST00000371176 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 LEAP2-201ENST00000296877 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 NUMB-211ENST00000554521 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 NUMB-231ENST00000559312 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms