Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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PKHD1P08F94 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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