Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

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Length 1,280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZNF208O43345 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZNF208O43345 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF208O43345 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZNF208O43345 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ZNF208O43345 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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ZNF208O43345 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ZNF208O43345 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ZNF208O43345 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ZNF208O43345 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ZNF208O43345 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ZNF208O43345 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF208O43345 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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