Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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