Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HOXC11O43248 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HOXC11O43248 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HOXC11O43248 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HOXC11O43248 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HOXC11O43248 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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HOXC11O43248 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC11O43248 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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