Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDKO14874 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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