Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms