Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms