Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms