Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
COPS3Q9UNS2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPS3Q9UNS2 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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