Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms