Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms