Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms