Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRBP1Q9P2E9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms