Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms