Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKIRAS1Q9NYS0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms