Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SERINC1Q9NRX5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms