Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ASCL3Q9NQ33 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms