Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BPIFA1Q9NP55 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms