Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM5DQ9BY66 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM5DQ9BY66 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms