Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCP2Q9BX26 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms