Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPIN3Q9BQK8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LPIN3Q9BQK8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms