Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP9Q99956 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP9Q99956 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms