Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms