Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRIQ1Q96JM4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms