Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP13Q92995 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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USP13Q92995 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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USP13Q92995 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP13Q92995 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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USP13Q92995 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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USP13Q92995 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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USP13Q92995 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP13Q92995 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP13Q92995 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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