Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG3Q8WXD2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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