Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CATSPER4Q7RTX7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms