Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms