Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS13

RALGPS1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor RalGPS1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1Q5JS13 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RALGPS1Q5JS13 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms